那一年，微软在国内力推名为“维纳斯”的电视机顶盒业务，主打电视上网，当时看好者众多。然而，方兴东3月在《南方周末》上发表了《“维纳斯计划”福兮祸兮？》一文，指出，“若让微软独占，控制了标准，我们的产业将再次被挤入食物链的底层，将永远呆在产业的下游苟延残喘。把主动权交给过于贪婪的厂商，中国企业必将背上沉重的包袱；在信息化路上，中国老百姓也因此要付出更大的代价”。“当时大家对微软欢声一片，只有很少几个人意识到一枝独秀的微软会给中国的软件业带来什么。”

当年5月，方兴东将此前两年的研究所得和其他一些作品汇编组成了《起来——挑战微软霸权》一书，这可以说是对1999年那并未被太多人关注的IT产业影响最重要的一本作品。当年9月，方兴东选择休学，发起创建国内第一家专业的互联网研究和咨询机构——互联网实验室，任董事长兼首席分析家。

在这之后，作为“微软斗士”的方兴东逐渐被人们淡忘，而作为“博客教父”的方兴东却为人熟知。2002年，方兴东和合作者王俊秀最先将Blog翻译成“博客”。此后，他还撰写了《中国博客宣言》，将博客比喻成信息时代的麦哲伦。在宣言的最后，方兴东高呼：“博客文化能引领中国向知识社会转型，博客关怀能开启一个负责的时代。”再后来，方兴东成立了“博客中国”，并于2005年获得了1000万美元的风险投资，在最巅峰时“博客中国”全球排名60多位，当时壮志满满的方兴东还喊出“一年超新浪，两年上市”的壮志。

很可惜，高调的表态，也引发了业内巨头的窥伺。新浪随后推出博客2.0公测版并通过名人效应迅速在博客领域“圈地”，而方兴东的“博客中国”却泯然众生。

沉寂多年的方兴东，在2014年再度“红火”了一把，在他当年那本《起来——挑战微软霸权》出版整整15年后，国家工商总局终于对微软开始进行反垄断调查。“和国家战略发展有关，当年发展为主，现在则是从发展到安全”，方兴东如此看待这迟到15年的观点认可。

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